简报

本表以LPSN网站的分类为基础（当前版本2008年1月7日），本分类代表原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统，同时参考NCBI Taxonomy，但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意其区别。

中文名称采用惯例（包括网上搜索途径）以及拉丁名直接意译，部分参考《细菌名称》第二版，拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。

本表列到属级。 后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。

参见：细菌。

酸杆菌纲(Acidobacteria)

1. 酸杆菌目(Acidobacteriales)
   1. 酸杆菌科(Acidobacteriaceae)
      1. 酸杆菌属(Acidobacterium)
      2. 土壤杆菌属(Edaphobacter)
      3. (Terriglobus)

全噬菌纲(Holophagae)

1. 石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)
   1. 石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)
      1. 石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)
2. 全噬菌目(Holophagales)
   1. 全噬菌科(Holophagaceae)
      1. 地发菌属(Geothrix)
      2. 全噬菌属(Holophaga)

放线菌纲(Actinobacteria)

1. 酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)
   1. 酸微菌目(Acidimicrobiales)
      1. 酸微菌亚目(Acidimicrobineae)
         1. 酸微菌科(Acidimicrobiaceae)
            1. 酸微菌属(Acidimicrobium)
         2. (Iamiaceae)
            1. (Iamia)